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2022足球世界杯32强Microchem实验室使用最先进的基因定序器识别未知的细菌和真菌。这篇文章解释了服务背后的科学。

第一步:PCR扩增

从DNA提取环境隔离,聚合酶链反应(PCR)进行放大的小区域的DNA用于标识隔离。对于细菌来说,16 s rRNA (rRNA)基因序列。16 s rRNA序列是常见的所有细菌物种,而且可以用于研究细菌之间的系统发育关系。通常MicroSEQ ID的工作负载,第一个500个核苷酸基地(A、C、G和T DNA)的序列是否足以识别大多数的物种。真菌,D2地区较大的核糖体rna分子作为核糖体是最常用的鉴定。

在这些放大区域是守恒的,相同的部分,和一些高变的,或广泛的不同取决于物种。守恒的地区作为一个框架,可以用来放大DNA,和每个物种的变异度高的地区允许指纹。您可能会注意到,细菌和真菌都是确定使用核糖体序列——这些普遍的生物标志物是常见的所有生命,还分不同允许可靠的识别的物种。

科学背后的ID未知的细菌和真菌

下一个:周期序列

添加个人执行第二轮PCR荧光放大DNA核苷酸,每个类型的核苷酸都有一个独特的颜色。彩色的核苷酸只是添加到每个新的DNA片段,并放大结束在不同的长度的DNA提供一系列的碎片。作为一个例子,一个从DNA序列的“AATCGA”后将产生以下所有周期序列:“AATCGA”,“AATCG”、“AATC”,“体”、“AA”,“a”——每一块最后标注颜色的基础。这是Sanger测序的一种形式,不同大小的块将被用来读最后一个序列。

下一个:毛细管电泳

样品注入薄,毛细血管含有凝胶,降低放大的DNA片段。运行一个强大的电场在毛细管,另一端带负电的DNA。更大的DNA片段通过毛细管运行慢,和小块更快。这就是所谓“电泳”,是关键的DNA序列方法确定。在毛细管的结束是一个相机检测器也可以识别每一个4彩色的核苷酸。使用“AATCGA”序列的例子之前,首先最初的“A”将到达检测器,紧随其后的是“AA”,然后“AAT”。探测器只能看到从每段的最后一个核苷酸的颜色,所以它会读取第一个“A”,然后另一个”,然后“T”,等等。通过这种方法,遗传密码正在慢慢建立,直到最后一个序列是放在一起。

最后:图书馆搜索和系统发育分析

检测DNA序列最终验证库相比,其他的从其他细菌或真菌的核糖体rna序列。Microchem使用MicroSEQ ID验证库,包含超过20000个物种。序列是所有其他物种相比,在图书馆,构建系统发育树,图表显示的最亲密的关系开始隔离其他已知的物种。新序列的相似性百分比这些亲密相关的物种,和99%或更大的序列相似性用于分类隔离作为一个特定的物种。

细菌的系统发育树的例子

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